Con el apoyo de POYRY de Finlandia y la Alianza en Energía y Ambiente con Centroamérica, esta investigación consistió en la caracterización de la biodiversidad de microalgas que habitan el Lago Amatitlán. En ella se describe la taxonomía de las especies identificadas: 7 especies de macrófitos y 48 de microalgas, entre ellas 15 especies pertenecen a Cyanophyta, 23 especies de Chlorophyta, 7 especies de Bacillariophyta y 2 especies de Euglenophyta. En esta investigación se identificaron colonias de la especie Microcystis aeruginosa, la más abundante como consecuencia del nivel de eutrofización del lago. Se desarrollaron técnicas de muestreo, micromanipulación, cultivos de biomasa y aislamiento de 8 especies que se adaptan a sistemas de cultivo y crecimientos en sistemas controlados.
